Paris, sous le règne de Louis XIV. Sébastien de Noilat, un herboriste, passe la soirée avec des amis. Le lendemain, l'un d'entre eux est retrouvé mort et le commissaire Parisot accuse Charles. Pour innocenter son ami, Sébastien mène l'enquête, alors que plusieurs autres cadavres présentant les stigmates des cours d'anatomie dispensés par Pierre Dionis, chirurgien du roi.
